脑病中心由原脑病科、脑外科等科室组建而成，是国家中医药管理局“十一五”重点专科，“十二五”国家临床重点专科(中医专业)，是重庆市中医脑病主任委员单位，重庆市中医脑病学重点学科，重庆市名科。现有医护人员55人，其中高级职称8人，博士2人、硕士研究生10余人，重庆市中医药高级人才1名，重庆市卫健委名医传承项目人才4名，全国中医药创新骨干人才1名。
脑病中心的建立是针对“中风病”一体化诊疗管理平台，其专业科室及功能构成主要有3个病区：脑一病区、脑二病区、重症病房（脑三病区，包含：脑外科病区、NICU）;5个门诊诊断治疗室；以及脑病中心辅助科室(神经介入室、脑外科手术室、高压氧舱室、神经电生理室)。开放床位140张，年门诊量3万余人次，年住院量3千余人次，年手术200余台。
本中心主要救治疾病：脑内科、脑外科的所有疾病。中心优势病种：缺血性中风病（脑梗死），出血性中风病（脑出血），眩晕病（后循环缺血）。在治疗痴呆病（老年期痴呆）、不寐证（睡眠障碍）、头痛病、郁证（焦虑、抑郁）、颤证（帕金森氏病和其它锥体外系疾病）、痫病（癫痫）、痿证（周围神经病变、多系统萎缩、运动神经元病等）等疾病有丰富的临床经验。
本中心特色：率先采用中风一体化治疗中风病的管理模式。在诊疗过程中理法方药完整，辨证使用中药、中成药；广泛使用体针、腹针、艾灸、推拿、熏洗等中医治疗方法。开展的主要中医药特色疗法有头针透刺治疗共济失调，头针透刺治疗急性脑出血，腹针疗法治疗眩晕，补肾活血方配合针灸治疗痴呆，醒脑开窍针治疗中风后意识障碍等。针对中风病的治疗及预防，中心研发了脑血灵口服液、偏瘫康复液 、补肾活血片、中风1号、十味降脂片等院内制剂，广泛应用于临床中。
联系方式：脑一病区（城南将军路中医院2号楼6楼）：023-68355443（医生站）， 023-68355111（护士站）
脑二病区（碚峡路中医院6楼）：023-68355131（医生站），023-68355471（护士站）
脑三病区（城南将军路中医院2号楼7楼）： 023-68355443（医生站）， 023-68355111（护士站）
总院地址：重庆市北碚区将军路380号